三星Note3在恢复出厂设置后，系统数据通常会被清除，包括应用程序、用户数据和设置。这意味着如果你选择的是“恢复出厂设置”中的“格式化SD卡”选项，那么SD卡中的数据也会被清除。
不过，如果只是执行了“恢复出厂设置”而没有格式化SD卡，那么SD卡中的数据可能会被保留。但系统内的数据，如应用程序、用户设置、联系人、短信、照片等，都会被删除。
如果想要恢复系统数据，以下是一些可能的途径：
1. 备份恢复：如果之前有备份（例如通过三星的Smart Switch软件），可以在恢复出厂设置后使用该软件恢复数据。
2. Google账户同步：如果你之前有使用Google账户同步数据，登录后可以重新同步部分数据，如联系人、日历、Google照片等。
3. 第三方数据恢复软件：在恢复出厂设置之前，如果你没有备份，且数据对您很重要，可以考虑使用第三方数据恢复软件尝试恢复。但请注意，这并不是100%成功的，且可能需要付费。
4. 联系专业数据恢复服务：如果上述方法都无法恢复，可以考虑联系专业的数据恢复服务。
在使用任何第三方软件或服务之前，请确保它们是合法和安全的，避免造成数据丢失或隐私泄露。
